Un nuevo esfuerzo para secuenciar rutinariamente los genes de los virus que causan infecciones respiratorias graves, como la gripe y el RSV, podría conducir a mejores tratamientos y vacunas.
Salud
10 enero 2023
Imagen de microscopio electrónico de partículas de coronavirus SARS-CoV-2 NIAID-RML/INSTITUTO NACIONAL DE SALUD/BIBLIOTECA DE FOTOS DE CIENCIAS
Muestras de virus de personas con graves infecciones respiratorias, como la gripe y el RSV, en el Reino Unido se analizarán de forma rutinaria mediante secuenciación de ADN en un proyecto que podría conducir a mejores tratamientos y vacunas, así como a una advertencia más temprana de nuevos brotes peligrosos. La tecnología se probará en hisopos nasales almacenados de las pruebas de covid-19 a partir de finales de este año, antes de implementarse más ampliamente el próximo año.
El equipo detrás del proyecto, llamado Respiratory Virus and Microbiome Initiative, dice que no tiene conocimiento de ningún plan similar en otras partes del mundo, pero espera que otros países adopten el mismo enfoque. Para fomentar esto, hará que todos los métodos y datos estén disponibles gratuitamente.
“Esperamos que pueda ser utilizado a nivel mundial”, dice. ewan harrison en el Instituto Wellcome Sanger en Cambridge, Reino Unido, quien lidera el proyecto.
Si bien ha sido posible secuenciar genomas virales durante décadas, fue solo durante la pandemia de covid-19 que muchos países comenzaron a secuenciar de forma rutinaria miles de muestras, lo que reveló cómo el SARS-CoV-2, el virus detrás de la enfermedad, estaba evolucionando más rápido de lo esperado. Entre otras cosas, esta vigilancia genómica permitió a los investigadores detectar las primeras variantes de omicrón y corregir predecir que causarían una gran ola de casos en todo el mundo.
“Por primera vez en la historia de la humanidad, la genómica a gran escala ha brindado a los gobiernos y a los formuladores de políticas una advertencia sobre lo que sucederá en una epidemia, y creo que es un cambio realmente importante y profundo”, dice Harrison. “Es algo que creemos que es realmente importante para seguir construyendo”.
Muchos otros virus, como RSVTambién puede causar infecciones respiratorias graves, dice, pero nuestra comprensión de ellas es extremadamente limitada. “Aparte de una pequeña cantidad de secuenciación del genoma en los casos de gripe, en realidad no existe ninguna vigilancia genómica de rutina de estos otros virus”, dice Harrison.
En la actualidad, las pruebas comúnmente utilizadas para identificar virus que causan infecciones graves solo revelan de qué tipo son, como rinovirus o adenovirus, dice Judith Breuervirólogo del University College London.
La secuenciación del genoma completo de un virus revela mucha más información, que puede ser útil de muchas maneras. Para empezar, puede ayudar a garantizar que las personas reciban los tratamientos más efectivos. Algunos tratamientos con anticuerpos para covid-19 puede ser menos efectivo contra variantes más nuevaspor ejemplo, para que los médicos puedan dar tratamientos alternativos de inmediato si saben que alguien tiene una de estas variantes.
También puede conducir a mejores vacunas. Dado que la secuenciación del SARS-CoV-2 reveló que las variantes de omicron se habían extendido por todo el mundo y se habían vuelto dominantes, Las inyecciones de refuerzo de ARNm se han actualizado incluir dos de estas variantes, para que las vacunas sean más efectivas contra ellas.
La secuenciación genética también puede revelar cómo se propagan los virus y, por lo tanto, ayudar a contenerlos. Por ejemplo, si solo sabe que dos personas en cuidados intensivos tienen infecciones por rinovirus, no tendría idea si se infectaron en el hospital o en la comunidad, dice Breuer. La secuenciación puede decirnos si tienen exactamente el mismo virus y, por lo tanto, si medidas de control de infecciones hospitalarias necesita mejorar.
Por último, pero no menos importante, Harrison espera detectar nuevas enfermedades emergentes desde el principio. Las probabilidades de hacer esto serán mucho mayores si otros países también realizan vigilancia genómica de rutina.
Secuenciar cualquiera de una docena o más de tipos diferentes de virus que pueden estar presentes en una muestra es técnicamente más difícil que solo secuenciar uno, especialmente cuando el objetivo es hacerlo usando una prueba barata que podría usarse en cualquier parte del mundo. Es por eso que Harrison y su equipo perfeccionarán su enfoque utilizando hisopos almacenados antes de comenzar a analizar hisopos frescos de pacientes en estado crítico en colaboración con la Agencia de Seguridad Sanitaria del Reino Unido. A largo plazo, la esperanza es ampliar la vigilancia más allá de los que están gravemente enfermos ya otros tipos de virus.
Por ahora, los investigadores también planean secuenciar todo el material genético presente en algunas de las muestras de hisopos. Este enfoque, conocido como metagenómica, les permitirá identificar todo tipo de virus, bacterias y hongos presentes, lo que les permitirá estudiar el microbioma del tracto respiratorio.
“Los métodos y tecnologías que están desarrollando Ewan y Sanger serán extremadamente útiles”, dice Breuer. “Esta es una iniciativa increíblemente importante”.
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